Μπορεί να υπάρχει ασυμφωνία στο αν τα τρόφιμα σήμερα είναι ασφαλέστερα σε σχέση με το παρελθόν, αλλά σίγουρα η διαδικασία εφαρμογής της ασφάλειάς τους έχει γίνει πλέον πιο πολύπλοκη σε σχέση με οποιαδήποτε στιγμή του παρελθόντος. Παρά το γεγονός ότι έχουν αντιμετωπιστεί πολλές από τις προκλήσεις του παρελθόντος, αναπτύχθηκαν νέα προβλήματα. Την επιστημονική κοινότητα έχει απασχολήσει την τελευταία δεκαετία, αλλά και πιο πριν, το θέμα των γενετικά τροποποιημένων τροφίμων. Αν τα φάρμακα είναι το ένα εργαλείο που χρησιμοποιείται από τους κτηνοτρόφους για την βελτίωση της παραγωγής, τότε σίγουρα το άλλο είναι η γενετική μηχανική. Με τον όρο αυτό νοείται η μεταφορά γενετικού υλικού (DNA) από οργανισμούς ενός είδους σε οργανισμούς ενός άλλου είδους με τεχνικές γενετικής μηχανικής. Τα γενετικά τροποποιημένα τρόφιμα χαρακτηρίζονται από το γεγονός ότι προέρχονται από ή περιέχουν κάποιο συστατικό, το οποίο προέρχεται από γενετικά τροποποιημένο φυτικό ή ζωικό οργανισμό. Ο τελευταίος ορίζεται ως ένας οργανισμός στον οποίο με επιλεκτική επέμβαση στο γενετικό του υλικό έχει επιτευχθεί η παραγωγή προϊόντων είτε ανθεκτικών σε ορισμένους μικροοργανισμούς ή παράσιτα είτε με καινούριες ιδιότητες όπως βελτιωμένα οργανοληπτικά χαρακτηριστικά ή μεγαλύτερο χρόνο συντήρησης.